向 R CMD BATCH 和 Rscript 傳遞命令列引數
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使用
commandArgs()函式檢索 R 中的引數 -
使用
R CMD BATCH命令重定向 R 中的輸出 - 在 R 中建立指令碼並執行命令
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將命令列引數傳遞給 R 中的
R CMD BATCH命令 -
將命令列引數傳遞給 R 中的
Rscript
當使用命令列執行 R 指令碼檔案時，我們可能希望傳遞引數並將輸出儲存在檔案中。本文使用 R CMD BATCH 命令和 Rscript 前端演示了這些技術。
我們將從兩種方法共有的一些細節開始。
使用 commandArgs() 函式檢索 R 中的引數
應使用 commandArgs() 函式檢索在命令列上傳遞的引數。我們將使用引數 trailingOnly=TRUE。
該函式返回一個字元向量。
使用 R CMD BATCH 命令重定向 R 中的輸出
R CMD BATCH 命令將輸出重定向到 .Rout 檔案。該檔案包含輸入命令、結果和錯誤訊息。
使用 Rscript 前端，我們必須使用適當的 shell/終端命令來重定向輸出。對於幾個終端，它是 > 檔名。
我們可以在檔案開頭使用 options(echo=TRUE) 重定向輸入。錯誤訊息不會被重定向。
將輸出重定向到檔案時必須小心。如果檔案不存在，則會建立該檔案，否則將被覆蓋。
在 R 中建立指令碼並執行命令
要檢視每種方法的工作原理，請執行以下操作。
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使用給定的 R 程式碼建立一個檔案，並將其以副檔名
.R儲存在目錄中以執行 R 命令。 -
在包含指令碼檔案的目錄中開啟 shell。
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將給定的檔名替換為檔名後執行相應的命令。
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在這些示例指令碼中，第一個引數是
hobby，第二個引數是years。
將命令列引數傳遞給 R 中的 R CMD BATCH 命令
語法如下。
R CMD BATCH options "--args userargument1 userargument2" script_filename.R
引數不能包含空格。確切的引用將取決於使用的 shell。
--vanilla 選項結合了幾個 R 選項。
R 檔案的示例程式碼：
# Create 5 values in a sequence.
x = seq(from=0, to=20, by=5)
print(x)
# Get the arguments as a character vector.
myargs = commandArgs(trailingOnly=TRUE)
myargs
# The first argument is the text for hobby.
hobby = myargs[1]
hobby
# The second argument is the number of years of practice.
years = as.numeric(myargs[2])
years
命令：
R CMD BATCH --vanilla "--args Golf 8" script_filename.R
在輸入檔案的同一目錄中建立一個與輸入檔案同名、副檔名為 .Rout 的輸出檔案。
將命令列引數傳遞給 R 中的 Rscript
Rscript 是 R 的指令碼前端。
引數可能包含空格。這樣的引數需要用引號引起來。
語法如下。
Rscript script_filename.R 'user argument 1' userargument2 > rscript_output_file_name.txt
R 檔案的示例程式碼：
# To print the command and its result in the output.
options(echo=TRUE)
# five random values from the standard normal distribution
x = rnorm(5)
print(x)
# Get the arguments as a character vector.
myargs = commandArgs(trailingOnly=TRUE)
myargs
# The first argument is the text for hobby.
hobby = myargs[1]
hobby
# The second argument is the number of years of practice.
years = as.numeric(myargs[2])
years
命令：
Rscript script_filename.R 'Playing Guitar' 3 > rscript_output_file_name.txt
輸出檔案被建立。它有輸入和輸出，但沒有錯誤訊息。
參考和幫助
請參閱手冊的附錄 B，呼叫 R：R 簡介。
此外，請參閱 R 的 commandArgs() 函式和 Rscript 工具的文件。
Jesse is passionate about data analysis and visualization. He uses the R statistical programming language for all aspects of his work.